وتقوض هذه المشاكل التنمية الاقتصادية والاجتماعية في المنطقة بشكل كبير، حيث تحولت المنطقة إلى بؤرة من عدم الاستقرار بسبب الانقسامات العرقية والثقافية في فرغانة، الأمر الذي يؤثر عميقا على كل من الوادي وآسيا الوسطى.